書接上回介紹《神奇动物2：格林德沃之罪》

與此同時傲羅安娜（瑪格麗特•沃特斯頓飾）也在尋找克雷登斯。安娜和姐姐奎妮、麻瓜弗蘭克與紐特再一次相約在法國巴黎，而此次並非談情說愛而是為的是共同的目標，一同對付懷特德沃。

短短的幾十字講訴沒法羅琳的魔法世界，那場混戰將要引出前面陸陸續續展開更加宏偉的故事情節！整部電影還是發生了兩個熟識的神奇鳥類，超級粘人又屢立奇功的“護樹羅鍋”，對閃閃發光愛不釋手的“嗅嗅”，更加驚喜的還有我國山海經中的“騶吾”。這隻看上去殘忍無比，看見紐特手上的“逗貓棒”卻變為了一頭呆萌的大貓，也便是這隻大貓關鍵時刻託著紐特自己脫離險境。

電影漸漸褪去了下部中的親情和舒緩，慢慢在觀眾們面前展示出魔法世界的複雜與恢弘。J•K•羅琳構築的魔法世界中三個最為傑出的魔法師，懷特德沃、鄧默爾多展開了對決。這三個既愛又恨、互生情愫的世界頂級魔法師，開始了魔法世界中的正邪之戰。

懷特德沃在法國巴黎找出了曾被“默默地然”附體的克雷登斯（埃茲拉·瓊斯飾），即使懷特德沃指出這世界能殺了鄧默爾多的只有克雷斯登。

阿不思•鄧默爾多（裘•德洛飾）找出為人正直的紐特幫助他們共同制止那場公義與惡魔的內戰。

下部《神奇动物1》開頭紐特（埃迪•雷德梅恩飾）幫助美國魔法參議院抓住了黑女巫蓋勒特•懷特德沃（傑森•德普飾），懷特德沃在美國魔法參議院的拘留所裡度過了兩個月的獄中時光。但是，最終司法權還要交還給愛爾蘭魔法部。

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紐特返回了英國倫敦公司總部，但是他想繼續周遊世界找尋神奇鳥類的心願被限制。但是懷特德沃的迴歸，意味著魔法世界註定要經歷一番血雨腥風的鬥爭。紐特的同學

凶殘的懷特德沃早就佈置好了，在回到英國倫敦的馬路上逃脫的計劃，並且在部下的幫助下順利脫逃。史上法力最強大的黑女巫之一，野心最大、戾氣最大的懷特德沃要實現他們年輕時理想，統治魔法界和麻瓜世界。